申请单位应当提交下列材料:
(一)军工保密资质申请书;
(二)企业营业执照或事业单位法人证书复印件;
(三)登记机关备案的章程;
(四)承担或者拟承担涉密武器装备科研生产任务的证明材料，或者武器装备科研生产许可证。
注意重点来了
首次申请军工保密资质和延续申请军工一级保密资质单位:
可由军队装备承制单位资格审查申请受理点、中国科学院、相关军工集团公司、中国工程物理研究院总部保密工作机构、项目总承包单位保密工作机构审核项目密级，出具军工保密资质等级建议表;
若项目由国家国防科技工业管理部门及国务院其他相关部门管理，则可由项目主管部门审核密级，出具军工保密资质等级建议表或者立项批复等证明材料。
延续申请军工二级保密资质单位:
提交有效期内的武器装备科研生产许可证复印件;或提交可证明在资质有效期内已承担涉密任务的材料:
承担军队/军队授权单位下达的涉密项目，或国家国防科技工业管理部门下达的专项任务等，提交项目合同或立项批复文件复印件，并加盖申请单位保密工作机构公章，注明用途;
承担上述项目涉密协作配套任务，提交以下其一:
逐级追溯至项目下达单位，提交各级合同或立项批复文件复印件，并加盖相应合同乙方单位或承担单位保密工作机构公章，注明用途;
逐级追溯至军工集团公司(中国核工业集团有限公司、中国航天科技集团有限公司、中国航天科工集团有限公司、中国航空工业集团有限公司、中国船舶集团有限公司、中国兵器工业集团有限公司、中国兵器装备集团有限公司、中国电子科技集团有限公司、中国航空发动机集团有限公司、中国电子信息产业集团有限公司)、中国工程物理研究院及下属军工保密资质单位，提交各级合同复印件，并加盖相应合同甲方单位保密工作机构公章。
(五)涉密场所产权证书或超1年租赁合同复印件;
(六)国家保密行政管理部门要求的其他材料。
大家不难看出，新申请保密资质的企业，提交材料中登记建议表仍然是关键证明，但是在路径上多了一种选择，那就是立项批复等证明材料，能提供立项批复证明文件视为有效。
